Com duração prevista de 10 anos, as atividades planejadas no escopo do Programa Regional de Diversidade Biológica da Bacia/Região Amazônica devem se encerrar ao final de 2030, coincidindo com o período da Agenda 2030 para o Desenvolvimento Sustentável e a proposta de atualização da Agenda Estratégica de Cooperação Amazônica (AECA). Até lá, espera-se que a gestão da diversidade biológica e a proteção dos conhecimentos tradicionais dos povos indígenas, comunidades locais e outras comunidades tribais da Bacia/Região Amazônica esteja consolidada.